Častý problém uživatelů Ubuntu je spouštění, nebo spíše nespouštění JavaFX aplikací. Tento problém velmi často spočívá v instalaci jak OpenJDK, tak i javy od Sunu případně pouze prvního z nich. Ke spuštění JavaFX aplikace se využije OpenJDK a to způsobuje zmíněné problémy. Která java je nainstalovaná lze zjistit příkazem
sudo update-java-alternatives -l
Výsledek může vypadat například následovně:
java-6-openjdk 1061 /usr/lib/jvm/java-6-openjdk
java-6-sun 63 /usr/lib/jvm/java-6-sun
Řešení spočívá v instalaci Javy od Sunu (pokud ještě nemáte) a změně Java alternativy. Změna alternativy se provede následovně:
sudo update-java-alternatives -s java-6-sun
Pokud si budete později přát změnu na OpenJDK lze použít opět
sudo update-java-alternatives -s java-6-openjdk
Pokud si nyní chcete v prohlížeči spustit JavaFX nezapomeňte ho předtím restartovat.